中国本土猪种资源丰富多样,在适应不同地理环境的过程中演化出独特性状。一个引人瞩目的现象是:纬度越高(越靠北),猪的体长越长。这一适应性表型背后的分子机制长期是未解之谜。
近日,生命科学学院姜延志教授团队在生物学权威期刊《BMC Biology》在线发表题为“Latitude-Driven Adaptive Evolution of Body Length in Diverse Pig Breeds Across China”的研究论文,不仅填补了高质量中国地方猪基因组资源空白,更成功揭示了驱动纬度适应性体长变化的关键基因——AFF4。 该院动物学系2021级博士研究生王逸飞为论文第一作者,姜延志教授为通讯作者。

高质量基因组图谱:团队首先完成了高质量内江猪基因组的组装,并对来自中国不同纬度区域的297头地方猪和6头本土野猪进行了全面全基因组分析。研究系统绘制了中国地方猪种精细的遗传多样性和群体结构图谱,清晰揭示了不同地域猪种独特的遗传背景,为本土猪遗传资源保护与利用奠定了重要基础。
确认纬度-体长关联:基因组数据确凿地证实,在中国猪种中,体长与分布纬度之间存在显著正相关性,凸显了环境适应性对这一重要经济性状的塑造作用。
锁定关键基因AFF4:为破解遗传密码,团队创新性地运用四种独立的计算分析方法深度挖掘基因组数据。所有方法均一致指向同一个关键候选基因:AFF4。
群体遗传学证据:发现AFF4基因在低纬度猪种群体间存在特定的基因交流(渗入)模式,且该基因区域在不同猪种中表现出显著的单倍型分化。
功能实验验证:细胞实验证实,AFF4基因能显著调控“成骨分化”过程。
揭示进化驱动力:综合证据表明,AFF4基因在猪适应不同纬度环境、产生体长变异的过程中,受到了强烈的自然选择压力,是关键的“驱动基因”。
这一发现不仅深化了对动物适应性进化机制的理解,更重要的是,为未来猪的分子设计育种提供了宝贵的理论依据和候选靶点,有望助力培育更适应特定环境的优良猪种。
本研究得到四川省“十四五”川猪重大科技专项—川猪育种新材料创制与新品种培育(编号:2021ZDZX0008) 以及猪禽种业全国重点实验室共同资助。
全文链接:https://doi.org/10.1186/s12915-025-02265-0